Из сбрасываемых в Онежское озеро вод должен быть удален такой элемент как фосфор. Это рекомендации Хельсинской комиссии по защите Балтийского моря (Хелком), в которой принимает участие и Россия. Очистка сбросов позволит улучшить источники водоснабжения Петрозаводска и нескольких поселков Прионежья. Над этим сейчас работают в рамках проекта «Реконструкция и модернизация канализационных очистных сооружений Петрозаводска». Зачастую основным источником фосфора в сточных водах являются синтетические поверхностно-активные вещества, а также различного рода органика.
Тему затронули на заседании рабочей группы по ликвидации экологических «горячих точек» при местном Минприроды.
Отмечается, что таких точек на карте республики 42.
Также сообщается, что в 2018-2019 годах будут очищаться сточные воды в Медвежьегорске и Пудоже.